本发明适用于人工智能技术领域，提供了一种病历文件的编码方法、服务器及计算机可读存储介质，包括：从待编码的病历文件中获取病人的病历信息，并对病历信息进行分词处理，得到多个分词词语；基于预设的基准词序列确定各个分词词语的第一词向量；将所有分词词语的第一词向量导入预设编码模型，得到病历文件的第一编码概率向量、第二编码概率向量及第三编码概率向量；将第一编码概率向量、第二编码概率向量及第三编码概率向量中值最大的元素对应的编码分别确定为病历文件的第一类型编码、第二类型编码及第三类型编码，从而降低了人工成本，提高了病历文件的编码效率。