本发明针对DMWC系统中的随机相移提出一种高效测量矩阵相移校准方法，属于信号处理领域。DMWC系统固有的随机相移导致各通道信号的联合稀疏性被破坏，不能成功重构信号。根据频带宽度和节点距离估计节点与源点之间的相移大小，再利用各节点的相移乘以测量矩阵中相对应的行构造出校准矩阵，并利用校准矩阵和压缩采样数据恢复出信号支撑集。求残差与校准矩阵最大内积的索引值，找到该索引值的对称频谱位置加入到索引值向量当中，用多正交匹配追踪的迭代思想迭代更新，得到所有的支撑集。本发明使每个通道中的压缩采样数据不会因为存在随机相移而有所改变，实现了对相移的校准以及提高信号恢复性能的目的。本发明在其它低速采样系统（如MWC系统）中也适用。