本发明涉及一种基于模数转换器的高速数据传输方法及装置。其中方法包括以下步骤：A、将至少一个Sigma‑Delta模数转换器转换得到的数字信号经过数字滤波器进行滤波；B、对数字滤波后的信号进行二次编码处理后，采用差分信号输出；C、使差分信号通过防过饱和处理后，传输至解码器，用于生成供微处理器处理的解码信号。其中的装置包括：一个或多个数据采集模块，该数据采集模块包括Sigma‑Delta模数转换器、二次编码处理单元以及防过饱和电路；与所述数据采集模块并行连接的解码处理模块，该解码处理模块包括与微处理器的控制端连接的集中式解码器、以及与微处理器的数据输入端连接的数据分配单元。本发明采用曼彻斯特码进行信号编码以及差分信号进行信号传输，使得模数转换调制器的调制速度提升明显。