本发明属于计算机硬件技术，涉及一种实时检测差分时钟频率正确性的方法，本发明提出一种实时检测差分时钟频率正确性的方法，本发明通过分析现有时钟检测方法无法实时检测差分时钟的问题，设计差分时钟实时检测电路，该检测电路由时钟检测电路和检测结果输出电路组成，通过计数器计数的方式比较差分时钟与低速工作时钟计时是否一致，将结果通过软硬件方式进行告警输出。本发明可以实时检测差分时钟频率，在差分时钟频率异常时进行告警；本发明解决了差分时钟实时检测的问题，不需要差分示波器，无需测量硬件管脚，不增加外部电路，检测效率高，可以实时检测差分时钟频率并对时钟异常进行告警。