本发明公开了基于FPGA的精准自动频率跟踪的数字锁相放大处理方法，包括对被测信号通过信号预处理电路进行预处理得到离散信号；将离散信号进行FFT算法处理获得信号频率的粗略值；将粗略值作为中心频率由FFT锁相环对离散信号进行扫描，直至两路正交的本地参考信号和被测信号完成频率同步；将离散信号分别与两路本地参考信号相乘，分别得到差频项与和频项；再对差频项与和频项行低通滤波滤除高频分量，分别得到直流分量；最后对两路直流分量进行运算即可得到被测信号的幅值和相位；本发明利用DSPBuilder设计程序，使数字锁相放大器的设计更加灵活，易于开发；本发明使用FPGA做处理器和模块化的外围电路，使其便于作为模块应用到特定领域的测量仪器中。