本申请公开了一种RLE算法实现方法、系统、设备及计算机存储介质，应用于FPGA中，其中该方法包括：获取FPGA的并行数；从目标数据集中获取一组待编码数据，一组待编码数据中待编码数据的数量小于等于FPGA的并行数；采用预先编写的RLE算法同时对每一个待编码数据进行编码长度匹配计算，得到每一个待编码数据的运算结果；根据每一个待编码数据的运算结果确定当前获取的一组待编码数据的编码结果；判断是否完成对目标数据集的编码运算，若是，则结束，若否，则返回执行从目标数据集中获取一组待编码数据的步骤。本申请公开的一种RLE算法实现方法、系统、设备及计算机存储介质一次可对多个待编码数据进行RLE运算，编码效率高。