一种中红外ATR光纤耦合探头，属于生物医学光子学、分子光谱测定及装置技术领域。它包括ATR晶体探头（1）、入射光纤（2‑1）、出射光纤（2‑2）、手柄套（3）、双光纤保护层（4）、单光纤保护层（6）、连接套（5）、入射光纤跳线（7‑1）、出射光纤跳线（7‑2）。本发明通过采用中红外空心光纤和ZnSe晶体探头耦合的方法，并通过合理设计使其灵活、方便，可实现小面积单点探测和原位测量，同时又避免了光散射等因素引起的光谱变形，提高了红外光谱的质量，适于在体检测或活体检测，拓宽了ATR光谱测量技术在生物医学工程领域中的应用范围，在生物医学领域拥有广阔的应用前景。