本发明公开了一种基于GPS产生高精度触发脉冲的算法及装置，其技术方案是：以标称频率为目标频率的N倍的有源晶振的实际输出脉冲为基础，以GPS模块的秒脉冲为基准，计算出有源晶振的实际输出脉冲数和目标脉冲频率的N倍的频率的差值，用可编辑逻辑器件CPLD将这个频率的差值均分到分频的脉冲群里，所述目标脉冲频率即是高精度的触发脉冲频率。本发明采用GPS秒信号作为基准，使产生的触发脉冲的精度有了保证，并且采用插补脉冲的算法，使触发脉冲的均匀度非常高，另外采用温度补偿算法，保证了GPS短期丢星也能稳定的工作。