本发明公开了一种低噪声自动频率控制装置及其控制方法，该装置包括通信终端芯片和晶振，所述通信终端芯片包括锁相环和AFC校准模块，所述锁相环包括频率调整输出模块和可编程小数分频器，所述频率调整输出模块的输出端与可编程小数分频器的第一输入端连接，所述可编程小数分频器的输出端与频率调整输出模块的第一输入端连接，所述晶振的控制管脚连接至低噪声连接点，所述晶振的时钟信号输出端与频率调整输出模块第二输入端连接，所述AFC校准模块的输出端与可编程小数分频器的第二输入端连接。本发明将晶振连接至低噪声连接点，提高系统的接收性能，通过可编程小数分频器来控制分频比，节省芯片面积和功耗，可广泛应用于半导体技术领域。