本发明实施例提供一种飞行流量调控方法及系统，包括：生成包括多条染色体的N个种群，每条染色体包括每个航班的起飞时刻和飞行路径，然后将每条染色体分解为多条子染色体并进行种群内的交叉、变异处理，再将每个种群中的进化后的多条子染色体合并为进化后的多条染色体，最后根据进化后的多条染色体以及空域容量信息求得每个种群的空中交通拥挤度目标函数和航班延误时间目标函数的解集，通过该解集对目标解集进行更新，当进化结束后在目标解集中选取目标解，并按照目标解所对应的染色体中的起飞时刻和飞行路径对航班进行调控。从而实现了根据空域容量的动态变化对飞行流量进行动态调整的目标。