本发明提供一种本振小数分频器及其数字校准方法和电路，包括：整数分频电路，波形调整电路，数字逻辑电路、相位对齐电路、降采样电路、数字校准电路及多路信号合并电路；根据输入系统信号频率和所需的分频比对低精度数字时间转换器进行延时粗调，直至满足插入延时小于每相邻两相位的时间差；根据检测模块的输出信号调整调零控制字和调零步长，直至调零步长小于调零步长的最小值，以实现对高精度数字时间转换器的调零处理；然后，运用二分法调节数字控制延时模块，直至步长小于1，完成信号校准。本发明可校准器件不匹配导致的四路相位信号时间差不等而引起的杂散问题；与现有技术相比在数字电路复杂度相同的情况下，简化了模拟电路。