本发明涉及一种抑制扰动的锁相环，包括：输入端与参考时钟信号以及SDM调制器连接的第一延时模块，用于接收参考时钟信号和参考时钟信号进行相位调整的量化噪声，输入端与反馈时钟信号以及SDM调制器连接的第二延时模块，用于接收反馈时钟信号和SDM调制器输出的量化噪声，与第一延时模块和第二延时模块连接的鉴频鉴相器，用于对参考时钟信号和反馈时钟信号进行处理，得到相位误差信息，并根据相位误差信息输出控制信号。利用锁相环中SDM调制产生的量化噪声信号，并将量化噪声接入延时模块，对参考时钟信号进行相位调整，使得参考时钟信号和反馈时钟信号相位一致，并控制压控振荡器使得反馈时钟信号频率和参考时钟信号频率一致，消除扰动和噪声。