本发明属于航天大规模数字集成电路器件的可靠性研究领域，公开了一种星载短波红外探测器组件的制冷控制系统中，反熔丝FPGA的内部复位电路及方法。针对在星载短波红外探测器组件制冷控制系统中的反熔丝FPGA在安全性与可靠性方面存在的问题，通过设计一种反熔丝FPGA的内部复位电路及方法，为星载短波红外探测器组件的制冷机控制器增加定时复位功能和温差异常复位功能，从而使星载反熔丝FPGA在发生单粒子翻转后，经过一定时间可以复位到初始状态，避免了因为反熔丝FPGA功能失效而导致的系统工作状态异常始终无法恢复，从而提高制冷机控制系统在轨运行的安全性可靠性。