本发明公开了一种I/O口隔离功率可校准的微波治疗机控制装置。包括：功率信号隔离采集、超功率保护、欠功率处理、单片机电路、操作信号逻辑运算、功率复位、输出信号隔离传送、程序模块、三组输出互相隔离电源。功率信号隔离采集，采集微波治疗机功率信号并转换成可隔离传送的脉宽调制信号。超功率保护，当磁控管阳极过电流时进行保护。欠功率处理，当磁控管阳极电流太小时，进行欠功率处理。单片机电路和程序模块实现功率测量和可校准功能。操作信号逻辑运算，将各种控制信号做逻辑处理。功率复位，在微波治疗机开机时使输出功率为零。输出信号隔离传送，隔离输出功率控制信号和欠功率处理信号。三组输出互相隔离电源，为隔离的电路分别供电。