本发明公开了一种可变分数倍采样率的选取方法，首先获取抗混叠时采样率和采样率转换倍数的取值范围，取值范围与输出波形的重复频率相关，然后，根据DDWS波形发生器的最大采样率与DDWS波形发生器输出波形的重复频率的比值，DDWS波形发生器中滤波器的截止频率与DDWS波形发生器的最大采样率、DDWS波形发生器输出波形的最高频率与DDWS波形发生器的最大采样率的关系，获取采样率转换倍数的具体值并得到采样率。使其在避免频谱混叠的前提下尽可能地减小采样率点数，以减少DDWS波形发生器的硬件工作量和所需的存储深度。本发明中的采样率是可以随着输出波形的频率发生改变的，与输出波形之间的联系更紧密，灵活性更强，且减小了仪器的硬件工作量。