本发明公开了一种含有源阻尼滤波单元的矩阵变换器，包括输入电源、LC输入滤波单元、开关矩阵和微处理单元，输入电源提供的电流依次通LC输入滤波单元和开关矩阵输入到负载中，其中，微处理单元通过控制LC滤波器的谐振阻尼，进而对LC滤波器输入电流波形进行控制，以获得预期的输出电压，根据预期的输出电压分配开关矩阵中各开关管的脉冲，控制开关矩阵中各开关管的工作状态。本发明还提供了上述含有源阻尼滤波单元的矩阵变换器的控制方法。本发明改善动态特性，而且可以降低电源电流谐波含量，使电源侧始终接近单位功率因数，提高矩阵变换器的效率。同时有效抑制LC滤波器出现的谐振，降低电源电流的总谐波畸变率，减弱矩阵变换器对电网的影响。