本发明公开了一种降低两轴快速反射镜中X轴和Y轴耦合的控制方法。该方法在没有提高加工和装配要求的技术上，使X轴和Y轴的耦合度从2％以上降低至0.1％以内，有效提高了反射镜系统中X轴和Y轴控制稳定性、干抗扰能力和定位精度。【1】获取传递函数Gx、Gy以及耦合传递函数Gxy、Gyx；【2】应用MATALB软件设计满足指标要求的校正传递函数Gxc、Gyc；【3】设计补偿传递函数Gxyc、Gyxc；【4】搭建模拟/数字控制器；【5】利用模拟/数字控制器，对两轴快速反射镜进行控制。