本发明提供一种应用于LCD玻璃AOI测试的屏蔽干扰污点方法及系统，包括步骤：断开LCD玻璃的脚位供电，对LCD玻璃显示界面进行拍照得到初始图像；对LCD玻璃的单一脚位进行供电，对LCD玻璃显示界面进行拍照得到显示图像；对显示图像与模板图像进行对比，得到第一差异图像；对第一差异图像与初始图像对比，得到真实差异图像。能够实现对LCD玻璃上的污点进行屏蔽，使LCD玻璃通电后产生的图像进行准确识别，避免LCD玻璃因为玻璃上的污点而影响LCD玻璃正常生产的缺陷。