本发明涉及显微镜技术领域，具体涉及一种基于UVC传像的在体荧光显微镜镜头及荧光显微镜，旨在为了解决不同的图像之间的比较和图像后期的存储和分析的问题。本发明基于UVC传像的在体荧光显微镜镜头包括激发光光源、光路转换镜、梯度折射物镜、图像传感器和UVC传像模块，其中：激发光光源通过光路转换镜连接至梯度折射物镜；梯度折射物镜通过光路转换镜连接至图像传感器；UVC传像模块与图像传感器信号连接，用于将图像传感器采集的图像按照UVC协议编码。本发明的荧光显微镜镜头通过UVC成像模块按照UVC(USBvideoclass)协议进行编码以形成统一标准的图像，以利于不同的图像之间的比较和图像后期的存储、分析。