本发明涉及显微镜技术领域，具体涉及一种基于模拟视频信号的在体荧光显微镜镜头及荧光显微镜，旨在为了解决体积、重量大和安装不方便的问题。本发明基于模拟视频信号的在体荧光显微镜镜头包括激发光光源、光路转换镜、梯度折射物镜、模拟摄像机模组和视频采集卡，其中：激发光光源通过光路转换镜连接至梯度折射物镜；梯度折射物镜通过光路转换镜连接至模拟摄像机模组；视频采集卡与模拟摄像机模组信号连接，用于采集模拟摄像机模组输出的视频信号。本发明的荧光显微镜镜头整体体积小、重量轻，可安装在体型较小的活体(如小鼠)身上，采用柔性电缆连接，不影响其自由活动。