本发明涉及一种用于傅里叶叠层显微成像技术的图像增强方法，属于显微成像领域。本发明实现方法为，基于FPM系统选择照明光源及照明光源控制平台，根据不同的观察需求确定不同角度入射光的光强大小，并用相应的控制平台调整光强，实现照明光强不均匀误差补偿、提高采集图像的信噪比、增强图像细节等不同目的。本发明通过硬件调控不同位置照明光光强大小，代替了算法补偿或图像校正的过程，在图像采集之前提高了图像的信噪比。此外，本发明能任意调节不同位置照明光光强大小，可以根据观察者的不同需要增强或抑制图像不同频率成分，能满足不同的观察需求。