一种用于磁悬浮分子泵控制系统的数字电源装置，其主要包括AC/DC变换器模块、自供电模块、DSP控制模块、低压DC/DC模块、CAN通信接口模块以及HMI人机接口模块。该装置运行时，DSP控制模块根据给定电压值，采用电压传感器和电流传感器的输出作为反馈，通过PWM控制AC/DC变换器模块和高压DC/DC模块中的开关器件，构成电流电压的双闭环控制系统，二者的电压输出作为磁轴承的功放电源和低压DC/DC模块的输入，低压DC/DC模块的输出作为磁轴承系统的控制电源。当外部电网失效时，高压DC/DC模块依靠电机的回馈能量进行电压转换，继续为磁轴承系统提供电能，实现磁轴承的掉电保护功能。