本发明提供了一种多失效模式下多模型集成航空发动机运行可靠性评估方法，包括：分析多失效模式、建立多失效模式分析模型、建立评估备选模型、判断各模型的优劣、建立多模型集成评估模型、应用贝叶斯模型平均方法，分析多种失效模式对航空发动机运行可靠性的影响、采用马尔可夫链蒙特卡洛算法仿真计算航空发动机运行可靠性。本发明分别针对典型的失效模式，性能退化失效、结构强度失效和突发失效进行了分析，在众多备选模型中选择一个最优模型，再应用多模型集成技术，将多个模型集成到一个框架中进行航空发动机运行可靠性评估，提高航空发动机运行可靠性评估的准确性。