本发明提供一种飞机非相似余度刹车系统及其控制方法，其中系统包括：主刹车系统，包括机载液压源和液压管路，机载液压源通过液压管路与机轮刹车作动器连接，用于为机轮刹车作动器提供刹车动力；自馈能备份刹车系统，包括传动机构和液压泵，传动机构用于将机轮运动的机械能传递给液压泵，液压泵用于将传动机构获取的机械能转换为液压能以为机轮刹车作动器提供刹车动力；控制器，用于在接收到飞机刹车指令时，检测主刹车系统是否处于异常状态，如果是，则控制由自馈能备份刹车系统为机轮刹车作动器提供刹车动力，否则，控制由主刹车系统为所述机轮刹车作动器提供刹车动力；备份刹车系统不依赖机载液压源，使得管路布局简单，有效提高可靠性和可维护性。